Kriostat półautomatyczny dwukompresorowy (Cryotome FSE, Theromo Shandon) - Urządzenie do wysokiej jakości krojenia zmrożonych wycinków tkanki, dostosowane do różnorodnych próbek. Zakres regulacji temperatury wynosi od 0 do – 35 ºC. Regulacja grubości cięcia od 1 do 20μm w krokach co 1μm, oraz od 20 do 60μm w krokach co 5μm. Urządzenie pozwala na przygotowywanie preparatów mikroskopowych do badań histologicznych jak i do pomiarów z wykorzystaniem metod obrazowania MS, takich jak SIMS, czy DESI.
Urządzenie do napylania matrycy SunCollect firmy SunChrome jest niezbędne w procesie przygotowania próbek do analizy ich powierzchni metodą MSI. Pozwala ono na napylenie powierzchni próbki zarówno substancjami derywatyzującymi bądź enzymami, jak również na odpowiednie napylenie matryc MALDI tak, aby uzyskać odpowiednią warstwę kryształów niezbędną da analizy MALDI