Badania związane z aptamerami i badaniem nowotworów

Osoby zaangażowane: Anna Drabik, Joanna Ner, Jerzy Silberring

Badania

W naszych badaniach zajmujemy się wykorzystaniem aptamerów w chorobach nowotworowych,
oraz poszukiwaniem biomarkerów w różnych typach nowotworów, między innymi w raku prostaty, piersi, trzustki i żołądka.
Nasze zadania w badaniach:

1. Przygotowanie próbek klinicznych dla potrzeb analiz MS,
2. Opracowanie identyfikacji zmian w profilach glikozylacji białek u pacjentów z rakiem żołądka
   (predykcja, diagnostyka, terapia),
3. Porównawcza analiza ilościowa białek u pacjentów metodami label-free nanoLC-MS/MS.

Sprzęt

Laboratorium spektrometrii mas:

1. Spektrometr masowy AmaZon SL (Bruker-Daltonics, Niemcy): instrument wyposażony w analizator typu pułapka jonów oraz źródło electrospray (ESI) oraz nanoelectrospray (nanoESI)
2. Spektrometr masowy AmaZon ETD (Bruker-Daltonics, Niemcy): instrument pułapkowy ze źródłami jonów ESI/nanoESI, obrazowaniem typu desorption electrospray oraz fragmentacją typu ETD (obecnie w serwisie)
3. kapilarny chromatograf cieczowy Ultimate 3000 (Thermo, Niemcy)

Laboratorium elektroforezy żelowej:

1. Zestaw MiniProtean III do elektroforezy 1D (Bio-Rad, USA), 2 komplety
2. Zestaw do western blottingu (Bio-Rad, USA), 1 komplet
3. Zasilacze do elektroforezy i blottingu (Bio-Rad, USA), 2 sztuki
4. Komora do transferu półsuchego iBind (Thermo, USA)
5. System obrazowania żeli ChemiDoc XRs+ (światło widzialne/UV do fluorescencji)